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Este estudo demonstra que em *Marchantia polymorpha*, a especificidade de organelas da única proteína da família CLU é determinada pela splicing alternativa de um único éxon que altera o domínio TPR, direcionando a proteína para mitocôndrias ou plastídios e compensando a perda de genes por reformatagem do genoma.
O estudo demonstra que o gene bacteriano *anmK*, adquirido horizontalmente por carrapatos ancestrais e subsequentemente "eucariotizado", foi domesticado pelo hospedeiro para desempenhar um papel essencial na nutrição sanguínea e na reprodução, integrando-se profundamente à biologia e à aptidão reprodutiva desses vetores.
Este estudo fornece a primeira evidência genômica direta de que a seleção sexual em *Tribolium castaneum* reduz a carga de mutações deletérias e o risco de extinção sem comprometer a diversidade genética geral, validando um mecanismo evolutivo fundamental para a viabilidade populacional.
Este artigo apresenta uma nova abordagem de Bayes Empírico, implementada no pacote R mvMORPH, que supera as limitações computacionais dos métodos comparativos filogenéticos multivariados atuais, permitindo a análise eficiente e precisa de dados de alta dimensionalidade (como formas 3D e expressão gênica) para inferir parâmetros evolutivos e detectar convergência morfológica, como demonstrado no estudo da adaptação dietética em mamíferos.
Este artigo apresenta a teoria de Genética Fenotípica Probabilística (ProP Gen), um novo quadro matemático que demonstra como a incerteza fenotípica desafia princípios clássicos da genética populacional, acelera a travessia de vales adaptativos e explica fenômenos como o "flutuação fenotípica" e a dinâmica de bactérias persistentes, oferecendo assim ferramentas essenciais para prever a evolução de cânceres que exploram essa incerteza para evadir tratamentos.
Este estudo demonstra que a evolução de elementos regulatórios *cis* dependentes do contexto, particularmente em vias metabólicas como a do ácido araquidônico, é um mecanismo fundamental que permitiu a rápida adaptação de camundongos domésticos à escassez de água no Deserto de Sonora.
Este estudo apresenta o mapa evolutivo mais abrangente do selenoproteoma vertebrado, revelando expansões significativas em peixes de nadadeiras raiadas devido a duplicações genômicas e perdas convergentes em tetrápodes, o que reforça a hipótese de uma vantagem seletiva do selênio em ambientes aquáticos.
Este estudo utiliza dados genômicos globais de *Klebsiella pneumoniae* e amostragem de trajetórias de transição para mapear e prever as vias evolutivas da resistência antimicrobiana, identificando padrões consistentes e divergentes entre países que se correlacionam com políticas de uso de drogas e permitindo a previsão de dinâmicas futuras.
Este estudo demonstra que o desequilíbrio na expressão gênica entre machos e fêmeas no cromossomo X é generalizado em lagartos da família Phrynosomatidae, caracterizando-se pela superexpressão em fêmeas nas regiões ancestrais e pela subexpressão em machos nas regiões neo-X recém-adquiridas.
Este artigo apresenta a aplicação da estimação neural do posterior (NPE) na genética de populações, demonstrando que esse método combina a flexibilidade da inferência baseada em simulação com a eficiência do aprendizado de máquina para gerar estimativas de distribuição posterior precisas e com incertezas bayesianas, superando as limitações computacionais e de dimensionalidade de abordagens tradicionais como a ABC.
O artigo demonstra que a evolução biológica é governada por uma equação de estado geométrica que força a árvore da vida a se embutir em um manifold hiperbólico com curvatura universal e dimensão de 2,00, uma restrição topológica derivada da capacidade de informação do código genético e validada empiricamente por dados de genomas e proteínas.
Este estudo demonstra que ácaros *Varroa destructor* provenientes de colônias de abelhas melíferas resistentes na Europa apresentam consistentemente um tamanho corporal reduzido em comparação com os de colônias não resistentes, sugerindo uma mudança fenotípica induzida pelo hospedeiro que pode servir como novo marcador de seleção.
Este artigo propõe que a expansão de uma população humana moderna entre 400 e 250 mil anos atrás, utilizando tecnologia Lavallois, explica a origem dos neandertais na Europa através de intensa introgressão de genes arcaicos locais, enquanto na África o cruzamento com humanos arcaicos resultou em uma mistura mais modesta que gerou a profunda subestrutura genética observada em todos os humanos modernos hoje.
Este estudo quantifica o sinal filogenético em 35 traços de desenvolvimento em 157 espécies de primatas, revelando que o desenvolvimento dentário apresenta a maior conservação evolutiva e que, contra o esperado, traços que se desenvolvem mais tardiamente, como os dentes permanentes, são mais conservados do que os precoces.
Este estudo conclui que, embora existam diferenças nas cantarias entre as populações de pintassilgos dos Açores (Fringilla canariensis palmae) que habitam florestas de laurissilva e pinhal na ilha da Palma, essas variações não são suficientemente fortes para atuar como uma barreira comportamental pré-copulatória eficaz, sugerindo que outros fatores morfológicos e ecológicos são mais determinantes na diferenciação populacional.
Este estudo analisa como a paisagem de aptidão do SARS-CoV-2 mudou ao longo da pandemia, demonstrando que as alterações nos efeitos das mutações não sinônimas entre variantes distintas são explicadas em cerca de 50% por interações epistáticas entre as diferenças genéticas de fundo e os sítios mutados.
Este estudo demonstra que o deslocamento de caracteres reprodutivos em libélulas do gênero *Ischnura* ocorre de forma assimétrica, afetando principalmente as fêmeas ginocromas e os machos em zonas de hibridização específicas, o que ilustra como a hibridização pode gerar padrões de divergência reprodutiva dependentes do morfotipo.
Este estudo desenvolve uma plataforma de alto rendimento para mapear as restrições biofísicas multidimensionais na evolução de anticorpos, revelando que a epistasia mediada por rearranjos conformacionais permite que poucas trajetórias evolutivas específicas superem compromissos entre afinidade, expressão e auto-reatividade, facilitando a maturação para reconhecer variantes do SARS-CoV-2.
Este artigo apresenta o SHEPHERD, um novo quadro teórico que integra modelagem genética de populações e processos de decisão de Markov para desenvolver políticas adaptativas de drogas que reduzem a resistência evolutiva em populações heterogêneas, superando as limitações das abordagens tradicionais baseadas em seleção forte e mutação fraca.
Este estudo utiliza inferência bayesiana aproximada e análises de diversidade do cromossomo X para revelar que os tubarões-rei-cinza (*Carcharhinus amblyrhynchos*) do Indo-Pacífico possuem duas metapopulações antigas e distintas com contato secundário limitado, caracterizadas por uma demografia extrema com viés sexual que reduziu drasticamente a diversidade do cromossomo X, apoiando a designação das populações do Oceano Índico Ocidental e Central como Unidades Evolutivamente Significativas.